神农无法破解封印，又害怕强行开启会毁灭其中的财富，一时间焦头烂额。
然而就在那时，要塞最核心的区域、封印的门户中突然弥散出一丝丝黑暗的能量，让神农和手下的空忍吓了一跳。
那黑暗的能量有着邪恶的气息，似乎可以扰乱人的神志，让人发狂！
与此同时神农也不慎吸收了少量的黑暗能量，却惊讶地发现自己的查克拉变得异常活跃和强大！
这就是所谓的“黑暗查克拉”，其实原本根本不是什么充满“邪恶气息”的查克拉，那只是是零尾的能量融合了忍者的查克拉后的产物。
然后神农的大量手下就像是受到了空中要塞的诅咒发狂而自相残杀，整个要塞中残破的咒文都亮了起来，那些人产生的负面能量以及他们的查克拉、生命都被要塞所吞噬了。
这一幕原时空大概也发生过，之后神农就隐姓埋名，全忍界寻找寻找巨大的查克拉源，甚至是不惜屠杀大量普通人，还作死地把目标放在了九尾人柱力上。
通过研究吴哥要塞残破的科技，空忍的实力也有了一定的强化，几十年之后神农终于掌控了整个要塞，包括威力堪比尾兽玉的要塞巨炮，复兴了空忍。
又通过自己的研究释放了零尾，制造出黑暗查克拉。
只可惜几十年的不懈努力终于成功，神农却连自己几斤几两都不知道了，作死一般袭击木叶……
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